Команду створено у 2002 році. Її очолив колишній житель села Путрівка, вихованець Васильківської ДЮСШ, Матушевич Леонід Васильович, який під орудою тренера Чвирьова В. Т. за часів гри в ДЮСШ сам неодноразово ставав чемпіоном Київської області та брав участь в республіканських змаганнях. 

Вперше стартувавши у 2003 році у розіграші кубка Васильківського району команда відразу завоювала цей трофей. Крім того здобуто кубок Васильківського району з футзалу, кубок м. Василькова з міні-футболу. У футбольній першості Васильківського району команда посіла четверте місце. Своїми результатами та грою команда спонукала до будівництва нового стадіону, поле якого буде відповідати рівню республіканських змагань.

У 2004 році. Команда виграла кубок м. Василькова і Васильківського району з футзалу, стала чемпіоном Васильківського району, вийшла до фіналу Кубка області та стала четвертою командою в чемпіонаті Київської області у першій лізі.

У наступному сезоні ФК «Путрівка» завоював вісім футбольних трофеїв: стала чемпіоном Київської області з міні-футболу, виграла кубок і першість міста Василькова з футболу, стала володарем Кубка Васильківської міської федерації футболу, завоювала два перших місця в першості та кубку міста Василькова з футзалу, стала чемпіоном та володарем кубка Васильківського району.

В сезоні 2006 року команда здобула срібні медалі першості Київської області з футболу серед команд вищої ліги.

У 2007 році команда здобула кубок Васильківсього району з футболу, виграла першість району та завоювала золоті медалі першості області серед команд вищої ліги.

Сезон 2011 року команда Васильківського району почала з перемоги у Меморіалі Макарова. У фіналі ФК «Путрівка» з рахунком 2:1 обіграв ФК «Львів», ставши першим аматорським клубом серед перможців Меморіалу.

«Золото» турніру пам'яті Олега Макарова добули: Андрій Петров, Юрій Яковчук, Василь Скибенко — Олександр Пекний,Олександр Пустовіт, Олександр Нестерець, Сергій Шевченко, Сергій Сахно, Олександр Гайовий, Артем Цурупін —Ярослав Вишняк, Андрій Вітошинський, Руслан Періжок, Юрій Рачковський, Юрій Турчин, Віталій Лях, Максим Войцехівський, Олександр Поліщук, Петро Дмитренко — Юрій Медвєдєв, Юрій Галюк. Президент Леонід Матушевич. В цьому ж сезоні ФК «Путрівка» вперше в своїй історії декларувала готовність стартувати в аматорському чемпіонаті України з футболу, де отримала право змагатися за головний приз турніру в суперфіналі, програвши його команді «Нове Життя» з Андріївки, Полтавської області.

31 березня 2014 року ФК «Путрівка» знялась з вищої ліги чемпіонату Київської області з футболу.